23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2073 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2073  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  313  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4040  hypothetical protein  52.41 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795578  normal  0.404343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4154  putative inner membrane protein  52.41 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3986  putative inner membrane protein  73.33 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3967  hypothetical protein  52.41 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4091  hypothetical protein  52.41 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2671  hypothetical protein  40.43 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3193  hypothetical protein  40.62 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2526  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0996985  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2059  hypothetical protein  57.89 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0788801  normal  0.778065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2413  hypothetical protein  57.89 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1304  hypothetical protein  54.44 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31390  hypothetical protein  56.72 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0158922  hitchhiker  0.0000000000109597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0105  hypothetical protein  34.23 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0032  hypothetical protein  31.46 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0161  hypothetical protein  34.88 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1768  hypothetical protein  28.65 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0165694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3875  hypothetical protein  24.71 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2627  hypothetical protein  36.67 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2132  hypothetical protein  32.5 
 
 		 245 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48670  hypothetical protein  38.98 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761741  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1799  hypothetical protein  25.39 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2152  hypothetical protein  54.05 
 
 		 114 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.589145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>