21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2671 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2671  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  345  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31390  hypothetical protein  87.57 
 
 
170 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0158922  hitchhiker  0.0000000000109597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2526  hypothetical protein  74.11 
 
 
157 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0996985  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3193  hypothetical protein  74.11 
 
 
157 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.119025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2059  hypothetical protein  57.06 
 
 
157 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0788801  normal  0.778065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2413  hypothetical protein  79.78 
 
 
148 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1304  hypothetical protein  65.56 
 
 
135 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0032  hypothetical protein  40.46 
 
 
176 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0105  hypothetical protein  45.31 
 
 
147 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0161  hypothetical protein  35.33 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4040  hypothetical protein  55.22 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795578  normal  0.404343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4091  hypothetical protein  55.22 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261841  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3967  hypothetical protein  55.22 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3986  putative inner membrane protein  55.22 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4154  putative inner membrane protein  55.22 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.919611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2073  hypothetical protein  38.5 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48670  hypothetical protein  33 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4292  cell surface protein  51.02 
 
 
936 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1768  hypothetical protein  27.22 
 
 
165 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0165694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2627  hypothetical protein  40.7 
 
 
139 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  46 
 
 
953 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>