21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4091 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3967  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4091  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261841  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4154  putative inner membrane protein  98.86 
 
 
175 aa  347  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.919611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4040  hypothetical protein  98.86 
 
 
175 aa  347  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795578  normal  0.404343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3986  putative inner membrane protein  91.76 
 
 
182 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2073  hypothetical protein  54.04 
 
 
158 aa  144  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2526  hypothetical protein  44.85 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0996985  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3193  hypothetical protein  44.24 
 
 
157 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.119025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2671  hypothetical protein  41.27 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2059  hypothetical protein  59.7 
 
 
157 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0788801  normal  0.778065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2413  hypothetical protein  59.7 
 
 
148 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00882875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1304  hypothetical protein  59.7 
 
 
135 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31390  hypothetical protein  52.24 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0158922  hitchhiker  0.0000000000109597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0105  hypothetical protein  31.54 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0032  hypothetical protein  36.43 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0161  hypothetical protein  34.13 
 
 
171 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2132  hypothetical protein  34.78 
 
 
245 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1768  hypothetical protein  28.75 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0165694  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48670  hypothetical protein  37.29 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3875  hypothetical protein  28.32 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2627  hypothetical protein  32.88 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>