12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2132 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2132  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  31.73 
 
 		 2179 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  33 
 
 		 2272 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4040  hypothetical protein  34.78 
 
 		 175 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795578  normal  0.404343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4091  hypothetical protein  34.78 
 
 		 175 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3967  hypothetical protein  34.78 
 
 		 175 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3986  putative inner membrane protein  34.78 
 
 		 182 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4154  putative inner membrane protein  34.78 
 
 		 175 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0105  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  36.9 
 
 		 1008 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0098  cell wall anchor domain-containing protein  35 
 
 		 520 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0102  cell wall anchor domain-containing protein  35 
 
 		 520 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>