21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31390  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0158922  hitchhiker  0.0000000000109597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2671  hypothetical protein  89.27 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2526  hypothetical protein  57.31 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0996985  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3193  hypothetical protein  57.31 
 
 		 157 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2059  hypothetical protein  58.82 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0788801  normal  0.778065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2413  hypothetical protein  79.78 
 
 		 148 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1304  hypothetical protein  63.33 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0032  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0105  hypothetical protein  40.99 
 
 		 147 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0161  hypothetical protein  41.13 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4040  hypothetical protein  52.24 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795578  normal  0.404343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4091  hypothetical protein  52.24 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3967  hypothetical protein  52.24 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3986  putative inner membrane protein  52.24 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4154  putative inner membrane protein  52.24 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2073  hypothetical protein  40.7 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48670  hypothetical protein  35.16 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4292  cell surface protein  47.92 
 
 		 936 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1768  hypothetical protein  27.06 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0165694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4281  cell surface protein  40.74 
 
 		 953 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.533345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2627  hypothetical protein  43.28 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>