19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2526 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2526  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0996985  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3193  hypothetical protein  98.09 
 
 		 157 aa  303  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2059  hypothetical protein  84.71 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0788801  normal  0.778065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2671  hypothetical protein  54.75 
 
 		 179 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2413  hypothetical protein  84.27 
 
 		 148 aa  160  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31390  hypothetical protein  60.14 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0158922  hitchhiker  0.0000000000109597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1304  hypothetical protein  60 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0032  hypothetical protein  40.77 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0161  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4040  hypothetical protein  59.7 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795578  normal  0.404343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4091  hypothetical protein  59.7 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3967  hypothetical protein  59.7 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3986  putative inner membrane protein  59.7 
 
 		 182 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4154  putative inner membrane protein  59.7 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2073  hypothetical protein  61.19 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0105  hypothetical protein  39.47 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48670  hypothetical protein  32 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2627  hypothetical protein  33.03 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1572  hypothetical protein  54.55 
 
 		 119 aa  40.8  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>