18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0161 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0161  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  339  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0032  hypothetical protein  86.36 
 
 		 176 aa  290  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0105  hypothetical protein  46.78 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48670  hypothetical protein  45.87 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1304  hypothetical protein  48.31 
 
 		 135 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2059  hypothetical protein  38.64 
 
 		 157 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0788801  normal  0.778065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2671  hypothetical protein  43.81 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3193  hypothetical protein  43.14 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2526  hypothetical protein  43.14 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0996985  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31390  hypothetical protein  44.94 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0158922  hitchhiker  0.0000000000109597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2413  hypothetical protein  41.57 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2073  hypothetical protein  45.45 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4091  hypothetical protein  44.12 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3967  hypothetical protein  44.12 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3986  putative inner membrane protein  44.12 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4154  putative inner membrane protein  44.12 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4040  hypothetical protein  44.12 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795578  normal  0.404343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  31.14 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>