12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4497 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4497  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  657    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354512  normal  0.0165777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3061  hypothetical protein  44.41 
 
 		 300 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0080217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1232  hypothetical protein  43.28 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383177  hitchhiker  0.00088208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2814  hypothetical protein  41.74 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2043  hypothetical protein  37.77 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0348326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2142  hypothetical protein  27.05 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2141  hypothetical protein  27.03 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0575  hypothetical protein  28.11 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3299  hypothetical protein  28.85 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.153533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2719  hypothetical protein  26.44 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.177814  normal  0.953419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2720  hypothetical protein  25.98 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.198238  normal  0.55078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.46 
 
 		 576 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>