11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0575 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  660    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2142  hypothetical protein  50.89 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2141  hypothetical protein  52.78 
 
 		 334 aa  309  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3299  hypothetical protein  29.24 
 
 		 352 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.153533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3061  hypothetical protein  27.81 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0080217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2719  hypothetical protein  28.77 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.177814  normal  0.953419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2043  hypothetical protein  31.41 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0348326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4497  hypothetical protein  28.11 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354512  normal  0.0165777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2814  hypothetical protein  26.94 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1232  hypothetical protein  27.48 
 
 		 322 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383177  hitchhiker  0.00088208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2720  hypothetical protein  32.46 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.198238  normal  0.55078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>