11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3299 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3299  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  733    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.153533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2142  hypothetical protein  31.67 
 
 
333 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0575  hypothetical protein  29.24 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2141  hypothetical protein  29.37 
 
 
334 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2719  hypothetical protein  32.14 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.177814  normal  0.953419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2043  hypothetical protein  27.04 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0348326  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4497  hypothetical protein  28.85 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354512  normal  0.0165777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1232  hypothetical protein  25.12 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383177  hitchhiker  0.00088208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3061  hypothetical protein  29.56 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0080217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2814  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2720  hypothetical protein  26.52 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.198238  normal  0.55078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>