12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3061 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3061  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  610  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0080217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4497  hypothetical protein  45.42 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354512  normal  0.0165777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1232  hypothetical protein  42.24 
 
 		 322 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383177  hitchhiker  0.00088208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2043  hypothetical protein  40.38 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0348326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2814  hypothetical protein  39.94 
 
 		 321 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2141  hypothetical protein  28.37 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0575  hypothetical protein  27.81 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2142  hypothetical protein  26.4 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2720  hypothetical protein  27.89 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.198238  normal  0.55078 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3299  hypothetical protein  29.56 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.153533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.39 
 
 		 576 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2719  hypothetical protein  25.32 
 
 		 366 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.177814  normal  0.953419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>