12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2719 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2719  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  751    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.177814  normal  0.953419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2720  hypothetical protein  33.42 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.198238  normal  0.55078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 		 576 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2142  hypothetical protein  31.14 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.291854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2141  hypothetical protein  28.95 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0575  hypothetical protein  27.98 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3299  hypothetical protein  29.33 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.153533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1232  hypothetical protein  25.96 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383177  hitchhiker  0.00088208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3061  hypothetical protein  26.69 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0080217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4497  hypothetical protein  26.05 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354512  normal  0.0165777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2814  hypothetical protein  25.29 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2043  hypothetical protein  23.78 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0348326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>