More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6340 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4903  transposase IS66  84.53 
 
 		 529 aa  903    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6340  transposase IS66  100 
 
 		 530 aa  1097    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2793  transposase IS66  84.72 
 
 		 523 aa  941    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3808  transposase IS66  82.45 
 
 		 524 aa  898    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0436761  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6337  transposase IS66  58.72 
 
 		 544 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0065  putative transposase  58.17 
 
 		 526 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0077  putative ISPpu13, transposase Orf2  58.17 
 
 		 526 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3736  putative transposase  58.17 
 
 		 526 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1727  transposase  58.77 
 
 		 534 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4744  transposase IS66  57.9 
 
 		 546 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  40 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  39.8 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2203  transposase  35.9 
 
 		 530 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2211  transposase  35.9 
 
 		 530 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  41.67 
 
 		 694 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  41.29 
 
 		 530 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  41.48 
 
 		 530 aa  349  7e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  36.43 
 
 		 523 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0201  transposase IS66  36.24 
 
 		 523 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.228467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  39.88 
 
 		 510 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  39.88 
 
 		 510 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  36.02 
 
 		 527 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  39.5 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  40.28 
 
 		 510 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  40.28 
 
 		 510 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  40.28 
 
 		 510 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  38.33 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3056  transposase IS66  37.7 
 
 		 529 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  38.33 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  40.08 
 
 		 510 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  38.64 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  38.64 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1003  transposase IS66  40.16 
 
 		 581 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  38.64 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1616  transposase IS66  40.16 
 
 		 581 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.772385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  38.37 
 
 		 517 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0811  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.973056  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0470  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0833  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.65936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  38.19 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0751  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2753  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2684  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0678358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2943  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2598  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0515  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0046  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2953  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0973  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255905  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2404  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0229  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0031  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0144  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1061  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1293  transposase  38.8 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1672  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0115  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2163  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94613  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0080  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0175  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0219  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806088  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0389  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2486  transposase  39 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>