40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6284 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6284  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  71.11 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  71.11 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  71.11 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  71.11 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  71.11 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  64.44 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  68.89 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  65 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  54.17 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  55.56 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  55.56 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  55.56 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  53.33 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  53.19 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  54.55 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  53.33 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  53.33 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  57.5 
 
 		 216 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  53.33 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  48.89 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  57.78 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  58.97 
 
 		 205 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  53.33 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  58.97 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  58.97 
 
 		 228 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  58.97 
 
 		 216 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  51.11 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  51.11 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  55 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  48.89 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  55 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  55 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  51.22 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  51.22 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  51.22 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  62.86 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  43.18 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  55.26 
 
 		 194 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  42.22 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>