29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5855 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5855  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.095614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4992  hypothetical protein  84.64 
 
 		 280 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3413  TIM-barrel signal transduction protein  69.34 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4004  hypothetical protein  70.07 
 
 		 276 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0548  hypothetical protein  70.07 
 
 		 276 aa  394  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0212  hypothetical protein  70.07 
 
 		 276 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0877  hypothetical protein  69.52 
 
 		 277 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2780  hypothetical protein  68 
 
 		 276 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0656358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0757  hypothetical protein  70.07 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3029  hypothetical protein  69.52 
 
 		 276 aa  381  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2009  hypothetical protein  70.07 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0779525  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2104  hypothetical protein  70.07 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0518  hypothetical protein  70.07 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0701  hypothetical protein  70.07 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0591  hypothetical protein  70.07 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0883  hypothetical protein  69.68 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1656  hypothetical protein  70.07 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1403  hypothetical protein  66.42 
 
 		 276 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4815  hypothetical protein  63.9 
 
 		 281 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08932  TIM-barrel enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10110)  64.13 
 
 		 279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.56579  normal  0.312389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0881  transcriptional regulator  63.2 
 
 		 275 aa  346  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5787  transcriptional regulator  62.45 
 
 		 273 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  0.0228612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2397  hypothetical protein  61.48 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3718  transcriptional regulator  60.59 
 
 		 287 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2772  hypothetical protein  61.34 
 
 		 277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00186592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3987  TIM-barrel signal transduction protein  56.93 
 
 		 279 aa  323  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.661133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3796  hypothetical protein  57.62 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1534  transcriptional regulator  50.55 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7442  hypothetical protein  36.23 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>