29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2780 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2780  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0656358  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4004  hypothetical protein  75 
 
 		 276 aa  437  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0548  hypothetical protein  75 
 
 		 276 aa  437  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0212  hypothetical protein  75 
 
 		 276 aa  437  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3413  TIM-barrel signal transduction protein  75.72 
 
 		 276 aa  435  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0757  hypothetical protein  76.09 
 
 		 280 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0877  hypothetical protein  75.46 
 
 		 277 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1656  hypothetical protein  76.09 
 
 		 280 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2009  hypothetical protein  76.09 
 
 		 282 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0701  hypothetical protein  76.09 
 
 		 282 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2104  hypothetical protein  76.09 
 
 		 282 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0591  hypothetical protein  76.09 
 
 		 282 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0518  hypothetical protein  76.09 
 
 		 280 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0883  hypothetical protein  76.09 
 
 		 280 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3029  hypothetical protein  75.72 
 
 		 276 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1403  hypothetical protein  72.1 
 
 		 276 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4815  hypothetical protein  68 
 
 		 281 aa  387  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4992  hypothetical protein  67.64 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5787  transcriptional regulator  66.42 
 
 		 273 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  0.0228612 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5855  hypothetical protein  68 
 
 		 280 aa  351  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.095614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3718  transcriptional regulator  63.7 
 
 		 287 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3987  TIM-barrel signal transduction protein  61.76 
 
 		 279 aa  344  8e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.661133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0881  transcriptional regulator  60.89 
 
 		 275 aa  343  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08932  TIM-barrel enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10110)  61.85 
 
 		 279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.56579  normal  0.312389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2397  hypothetical protein  60.37 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2772  hypothetical protein  60 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00186592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3796  hypothetical protein  61.65 
 
 		 280 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1534  transcriptional regulator  49.63 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7442  hypothetical protein  39.49 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>