29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0877 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0877  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3413  TIM-barrel signal transduction protein  96.36 
 
 		 276 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4004  hypothetical protein  89.01 
 
 		 276 aa  510  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0548  hypothetical protein  89.01 
 
 		 276 aa  510  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0212  hypothetical protein  89.01 
 
 		 276 aa  510  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3029  hypothetical protein  87.27 
 
 		 276 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0757  hypothetical protein  79.85 
 
 		 280 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174271  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1656  hypothetical protein  79.85 
 
 		 280 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2009  hypothetical protein  79.85 
 
 		 282 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0701  hypothetical protein  79.85 
 
 		 282 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2104  hypothetical protein  79.85 
 
 		 282 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0591  hypothetical protein  79.85 
 
 		 282 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0518  hypothetical protein  79.85 
 
 		 280 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0883  hypothetical protein  79.49 
 
 		 280 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2780  hypothetical protein  75.46 
 
 		 276 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0656358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1403  hypothetical protein  71.06 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4815  hypothetical protein  71.22 
 
 		 281 aa  394  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4992  hypothetical protein  68.4 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5787  transcriptional regulator  63.24 
 
 		 273 aa  359  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  0.0228612 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5855  hypothetical protein  69.52 
 
 		 280 aa  347  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.095614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3987  TIM-barrel signal transduction protein  61.76 
 
 		 279 aa  347  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.661133  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08932  TIM-barrel enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10110)  62.91 
 
 		 279 aa  346  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.56579  normal  0.312389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3718  transcriptional regulator  61.11 
 
 		 287 aa  339  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2397  hypothetical protein  59.93 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2772  hypothetical protein  59.04 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00186592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0881  transcriptional regulator  60 
 
 		 275 aa  329  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3796  hypothetical protein  58.61 
 
 		 280 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1534  transcriptional regulator  45.96 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7442  hypothetical protein  39.62 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>