29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3413 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3413  TIM-barrel signal transduction protein  100 
 
 		 276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0877  hypothetical protein  96.36 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4004  hypothetical protein  87.68 
 
 		 276 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0548  hypothetical protein  87.68 
 
 		 276 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0212  hypothetical protein  87.68 
 
 		 276 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3029  hypothetical protein  88.04 
 
 		 276 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0757  hypothetical protein  79.35 
 
 		 280 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174271  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1656  hypothetical protein  79.35 
 
 		 280 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2009  hypothetical protein  79.35 
 
 		 282 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0701  hypothetical protein  79.35 
 
 		 282 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2104  hypothetical protein  79.35 
 
 		 282 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0591  hypothetical protein  79.35 
 
 		 282 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0883  hypothetical protein  79.71 
 
 		 280 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0518  hypothetical protein  79.35 
 
 		 280 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2780  hypothetical protein  75.72 
 
 		 276 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0656358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1403  hypothetical protein  71.74 
 
 		 276 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4815  hypothetical protein  70.55 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4992  hypothetical protein  68.61 
 
 		 280 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5787  transcriptional regulator  63.24 
 
 		 273 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  0.0228612 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5855  hypothetical protein  69.34 
 
 		 280 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.095614  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08932  TIM-barrel enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10110)  64.07 
 
 		 279 aa  352  4e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.56579  normal  0.312389 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3987  TIM-barrel signal transduction protein  62.5 
 
 		 279 aa  348  4e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.661133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3718  transcriptional regulator  61.48 
 
 		 287 aa  341  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2397  hypothetical protein  61.62 
 
 		 277 aa  338  7e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2772  hypothetical protein  60.74 
 
 		 277 aa  338  7e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00186592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0881  transcriptional regulator  60 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3796  hypothetical protein  59.41 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1534  transcriptional regulator  47.6 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7442  hypothetical protein  40 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>