29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7442 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7442  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5787  transcriptional regulator  43.68 
 
 
273 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  0.0228612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2780  hypothetical protein  40.22 
 
 
276 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0656358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2772  hypothetical protein  41.52 
 
 
277 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00186592  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2397  hypothetical protein  42.24 
 
 
277 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4004  hypothetical protein  39.13 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0548  hypothetical protein  39.13 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0212  hypothetical protein  39.13 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1403  hypothetical protein  38.77 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3718  transcriptional regulator  41.3 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0757  hypothetical protein  39.64 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174271  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1656  hypothetical protein  39.64 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405701  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0518  hypothetical protein  39.64 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0591  hypothetical protein  39.64 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0701  hypothetical protein  39.64 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2104  hypothetical protein  39.64 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2009  hypothetical protein  39.64 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0779525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4815  hypothetical protein  39.64 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0883  hypothetical protein  39.64 
 
 
280 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3413  TIM-barrel signal transduction protein  40.77 
 
 
276 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0877  hypothetical protein  40.38 
 
 
277 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3029  hypothetical protein  40.77 
 
 
276 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0881  transcriptional regulator  36.2 
 
 
275 aa  192  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3987  TIM-barrel signal transduction protein  37.99 
 
 
279 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.661133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1534  transcriptional regulator  39.27 
 
 
288 aa  185  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08932  TIM-barrel enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10110)  37.68 
 
 
279 aa  185  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.56579  normal  0.312389 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4992  hypothetical protein  37.18 
 
 
280 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3796  hypothetical protein  39.84 
 
 
280 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5855  hypothetical protein  36.96 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.095614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>