29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3029 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3029  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3413  TIM-barrel signal transduction protein  88.04 
 
 
276 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0877  hypothetical protein  87.27 
 
 
277 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4004  hypothetical protein  87.5 
 
 
276 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0548  hypothetical protein  87.5 
 
 
276 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0212  hypothetical protein  87.5 
 
 
276 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0757  hypothetical protein  80.07 
 
 
280 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174271  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1656  hypothetical protein  80.07 
 
 
280 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2009  hypothetical protein  80.07 
 
 
282 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0701  hypothetical protein  80.07 
 
 
282 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2104  hypothetical protein  80.07 
 
 
282 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0591  hypothetical protein  80.07 
 
 
282 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0518  hypothetical protein  80.07 
 
 
280 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0883  hypothetical protein  80.43 
 
 
280 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2780  hypothetical protein  75.72 
 
 
276 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0656358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1403  hypothetical protein  71.32 
 
 
276 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4815  hypothetical protein  71.17 
 
 
281 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4992  hypothetical protein  68.61 
 
 
280 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5787  transcriptional regulator  65.19 
 
 
273 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  0.0228612 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08932  TIM-barrel enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10110)  64.68 
 
 
279 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.56579  normal  0.312389 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3987  TIM-barrel signal transduction protein  62.73 
 
 
279 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.661133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3718  transcriptional regulator  62.87 
 
 
287 aa  341  7e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5855  hypothetical protein  69.52 
 
 
280 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.095614  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2397  hypothetical protein  61.34 
 
 
277 aa  333  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2772  hypothetical protein  60.22 
 
 
277 aa  332  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00186592  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0881  transcriptional regulator  60.74 
 
 
275 aa  330  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3796  hypothetical protein  59.19 
 
 
280 aa  297  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1534  transcriptional regulator  47.97 
 
 
288 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7442  hypothetical protein  40 
 
 
277 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>