29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1403 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1403  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0757  hypothetical protein  72.83 
 
 
280 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0518  hypothetical protein  72.83 
 
 
280 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2780  hypothetical protein  72.1 
 
 
276 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0656358  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0883  hypothetical protein  73.19 
 
 
280 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0591  hypothetical protein  72.83 
 
 
282 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0701  hypothetical protein  72.83 
 
 
282 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2104  hypothetical protein  72.83 
 
 
282 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2009  hypothetical protein  72.83 
 
 
282 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0779525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1656  hypothetical protein  72.83 
 
 
280 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405701  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0212  hypothetical protein  70.65 
 
 
276 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4004  hypothetical protein  70.65 
 
 
276 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0548  hypothetical protein  70.65 
 
 
276 aa  407  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0877  hypothetical protein  71.06 
 
 
277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3413  TIM-barrel signal transduction protein  71.74 
 
 
276 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3029  hypothetical protein  71.32 
 
 
276 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4815  hypothetical protein  67.64 
 
 
281 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4992  hypothetical protein  67.52 
 
 
280 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0836606  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3718  transcriptional regulator  64.81 
 
 
287 aa  359  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5787  transcriptional regulator  63.1 
 
 
273 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal  0.0228612 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5855  hypothetical protein  66.42 
 
 
280 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.095614  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3987  TIM-barrel signal transduction protein  59.41 
 
 
279 aa  334  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.661133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0881  transcriptional regulator  58.3 
 
 
275 aa  326  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08932  TIM-barrel enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10110)  60.07 
 
 
279 aa  325  5e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.56579  normal  0.312389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2397  hypothetical protein  59.63 
 
 
277 aa  324  8.000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2772  hypothetical protein  58.89 
 
 
277 aa  321  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00186592  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3796  hypothetical protein  59.58 
 
 
280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1534  transcriptional regulator  47.43 
 
 
288 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7442  hypothetical protein  38.04 
 
 
277 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>