46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3069 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  100 
 
 		 167 aa  344  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  73.37 
 
 		 169 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  73.96 
 
 		 169 aa  251  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  70.41 
 
 		 169 aa  248  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  62.87 
 
 		 167 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  62.87 
 
 		 204 aa  228  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  62.87 
 
 		 167 aa  227  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  60.56 
 
 		 175 aa  197  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  45.45 
 
 		 164 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  46.99 
 
 		 169 aa  167  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  42.94 
 
 		 167 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  47.5 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  44.05 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  37.34 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  36.84 
 
 		 182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  33.89 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  34.29 
 
 		 227 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  36.55 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  35.71 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  36.67 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  36.99 
 
 		 186 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  33.12 
 
 		 199 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  35.46 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  35.47 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  35.47 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  32.45 
 
 		 209 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  35.09 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  31.87 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  33.53 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  37.23 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  28.05 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  28.05 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  30.72 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  26.8 
 
 		 241 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  26.46 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  27.81 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  27.45 
 
 		 225 aa  62  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  28.95 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  25.76 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  26.71 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  23.08 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1424  hypothetical protein  52.63 
 
 		 39 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  22.56 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  28.74 
 
 		 312 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  27.2 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>