44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0080 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  344  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  99.4 
 
 		 204 aa  344  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  89.22 
 
 		 167 aa  315  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  62.87 
 
 		 167 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  60.95 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  66.43 
 
 		 175 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  61.54 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  58.58 
 
 		 169 aa  201  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  54.82 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  43.9 
 
 		 164 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  45.24 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  40.37 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  40.85 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  40.36 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  36.47 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  38.36 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  37.93 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  38.36 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  38.36 
 
 		 209 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  37.24 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  36.17 
 
 		 227 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  37.24 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  33.76 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  34.04 
 
 		 227 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  36.17 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  30.64 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  30.64 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  31.82 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  38.03 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  31.03 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  32.31 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  26.51 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  28.31 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  30.83 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  27.39 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  26.67 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  26.28 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  23.68 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  27.33 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  24.5 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  25.17 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1424  hypothetical protein  55.26 
 
 		 39 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  26.09 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>