43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3015 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  65.87 
 
 		 176 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  65.87 
 
 		 176 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  69.64 
 
 		 175 aa  225  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  60 
 
 		 176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  58.76 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  53.25 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  45.39 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  35.71 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  30.51 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  31.58 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  30.41 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  27.16 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  31.5 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  26.88 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  26.09 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  30.43 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  25.28 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  29.59 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  26.51 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  26.51 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  28.32 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  25.58 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  31.58 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  25.3 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  27.88 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  35.9 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  25.44 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  26.32 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  23.33 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  27.78 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  27.54 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  25.86 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  25.64 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  28.28 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  26.92 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  26.92 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  26.21 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  23.53 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>