45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0242 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  74.6 
 
 		 209 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  77.56 
 
 		 182 aa  267  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  74.57 
 
 		 192 aa  267  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  75.97 
 
 		 182 aa  261  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  69.95 
 
 		 191 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  69.06 
 
 		 199 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  47.26 
 
 		 227 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  45.52 
 
 		 178 aa  141  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  41.21 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  33.16 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  38.36 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  37.67 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  36.99 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  36.99 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  36.55 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  35.62 
 
 		 167 aa  104  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  32.93 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  35.42 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  37.93 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  33.56 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  33.56 
 
 		 169 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  34.56 
 
 		 173 aa  91.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  33.56 
 
 		 169 aa  90.9  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  34.38 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  30.9 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  30.9 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  30.2 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  30.97 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  29.45 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  29.13 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  35.19 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  26.71 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  27.4 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  28.47 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0638  hypothetical protein  26.23 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  23.94 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  28.67 
 
 		 312 aa  41.2  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>