46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3373 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  40.88 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  36.94 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  36.94 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  38.51 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  40.61 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  37.06 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  40.76 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  36.11 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  39.18 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  35.03 
 
 		 182 aa  103  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  36.5 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  34.29 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  34.67 
 
 		 209 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  35.09 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  33.8 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  37.12 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  36.02 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  34.07 
 
 		 227 aa  89  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  34.18 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  35.48 
 
 		 169 aa  87.8  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  33.57 
 
 		 227 aa  87.4  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  35.53 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  36.3 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  33.73 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  31.82 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  31.82 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  34.53 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  34.34 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  29.3 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  34.04 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  29.01 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  29.01 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  29.01 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  27.16 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  23.95 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  24.57 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0638  hypothetical protein  26.8 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  22.42 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  31.25 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  25.6 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  27.27 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  30.14 
 
 		 312 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>