46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4170 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  349  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  71.6 
 
 		 169 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  70.41 
 
 		 167 aa  248  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  72.78 
 
 		 169 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  60.95 
 
 		 167 aa  214  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  58.58 
 
 		 167 aa  201  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  58.58 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  57.04 
 
 		 175 aa  184  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  50.3 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  45.51 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  44.1 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  41.07 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  45.07 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  39.74 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  38.51 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  38.04 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  36.49 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  34.73 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  39.04 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  36.99 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  34.93 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  35.17 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  34.48 
 
 		 227 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  31.21 
 
 		 227 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  32.93 
 
 		 203 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  37.12 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  30.49 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  33.72 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  33.72 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  33.71 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  29.81 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  28.39 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  35.94 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  32.52 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  29.8 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  29.8 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  27.45 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  27.27 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1424  hypothetical protein  55.26 
 
 		 39 aa  52  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  24.82 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  31.29 
 
 		 312 aa  50.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  22.22 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  26.4 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  25.16 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  23.81 
 
 		 166 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>