44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3314 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  62.86 
 
 		 175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  61.11 
 
 		 182 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  60 
 
 		 176 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  60 
 
 		 176 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  59.6 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  52.6 
 
 		 175 aa  151  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  46.48 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  38.62 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  39.18 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  36.88 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  32.18 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  34.03 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  35.46 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  33.8 
 
 		 191 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  30.28 
 
 		 227 aa  88.2  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  33.53 
 
 		 167 aa  88.2  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  32.87 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  32.02 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  29.19 
 
 		 227 aa  85.5  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  32.39 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  33.71 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  34.38 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  39.2 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  30.88 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  31.14 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  33.88 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  32.31 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  34.27 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  29.38 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  29.86 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  35.12 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  28.66 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  29.71 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  26.83 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  26.88 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  27.01 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  27.01 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  27.33 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  29.22 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  24.66 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  23.57 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>