44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0267 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  70.89 
 
 
182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  62.86 
 
 
177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  60.23 
 
 
176 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  60.23 
 
 
176 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  63.51 
 
 
176 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  56.43 
 
 
168 aa  174  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  52.6 
 
 
175 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  37.5 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  34.72 
 
 
175 aa  94.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  36.22 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  35.16 
 
 
199 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  36.22 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  30.16 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  32.56 
 
 
191 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  29.29 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  31.43 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  28.38 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  30.72 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  29.13 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  30.68 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  32.52 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  30.97 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  29.07 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  26.43 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  33.1 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  29.34 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  30.83 
 
 
204 aa  70.9  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  30.83 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  30 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  28.31 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  28.67 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  27.4 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  29.65 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  25.15 
 
 
206 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  28.47 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  26.11 
 
 
203 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  25.97 
 
 
241 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  29.37 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  27.92 
 
 
227 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  27.92 
 
 
227 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  26.62 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  23.02 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0638  hypothetical protein  21.89 
 
 
192 aa  40.8  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>