72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2780 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2780  adenylate cyclase  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  66.67 
 
 		 162 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  64 
 
 		 162 aa  204  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  53.69 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  54.42 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4074  adenylate cyclase  47.77 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2597  adenylate cyclase  45.64 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  46.26 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1263  adenylate cyclase  46.62 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.708704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  45.64 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2493  adenylate cyclase  46.62 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2970  adenylate cyclase  43.31 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485889  hitchhiker  0.0000193778 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1805  adenylate cyclase  45.7 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3561  adenylate cyclase  46.67 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2545  adenylate cyclase  46.67 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1903  adenylate cyclase  41.89 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00185179  hitchhiker  0.00135379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3052  adenylate cyclase  42.11 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1910  adenylate cyclase  39.35 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1849  adenylate cyclase  45.27 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  44.67 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0553  adenylate cyclase  44.23 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  41.89 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  46.62 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1305  adenylate cyclase  42.48 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  44.97 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1972  adenylate cyclase  44.59 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6085  adenylate cyclase  43.24 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0896962  decreased coverage  0.000860765 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1526  putative adenylate cyclase family protein  42.04 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.395104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1469  adenylate cyclase  42.04 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00690729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2454  hypothetical protein  42.28 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0920685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  46.98 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3399  adenylate cyclase  42.57 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6613  adenylate cyclase  44.59 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2092  adenylate cyclase  43.33 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218396  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3082  adenylate cyclase  42.57 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  44.3 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2731  adenylate cyclase  43.62 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  43.42 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3276  adenylate cyclase  43.62 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01723  adenylate cyclase  43.59 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  38.93 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  41.61 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1325  adenylate cyclase  41.89 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0285  hypothetical protein  41.72 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0645  adenylate cyclase  44.67 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0967882  normal  0.674307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  42.18 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  40.88 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2407  hypothetical protein  42.11 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26851  hypothetical protein  40.27 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02281  hypothetical protein  36.91 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0794141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1522  hypothetical protein  36.91 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  42 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02800  hypothetical protein  38.78 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01721  adenylate cyclase  33.56 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  39.87 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  37.58 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01731  hypothetical protein  32 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0157  hypothetical protein  30.87 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.769937  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01751  hypothetical protein  31.37 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.690829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2877  adenylate cyclase  39.24 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000889515  normal  0.0335198 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0257  hypothetical protein  32.12 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.150674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1698  adenylate cyclase  36.77 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409123  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  37.01 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0825  adenylate cyclase  34.38 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01841  hypothetical protein  29.53 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  31.25 
 
 		 467 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0070  hypothetical protein  39.13 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1579  hypothetical protein  34.31 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12700  hypothetical protein  35.35 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1116  hypothetical protein  26.29 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0462  adenylate cyclase  27.88 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0307  hypothetical protein  28.19 
 
 		 268 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>