26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0257 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0257  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  912    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.150674  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  36.22 
 
 
467 aa  205  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1698  adenylate cyclase  33.13 
 
 
156 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409123  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0368  hypothetical protein  28.25 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.752828  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0345  hypothetical protein  28.25 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1640  hypothetical protein  28.62 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.934729  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2780  adenylate cyclase  32.12 
 
 
157 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  29.75 
 
 
151 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  31.25 
 
 
162 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  29.88 
 
 
182 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4074  adenylate cyclase  27.54 
 
 
156 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  31.87 
 
 
162 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  28.3 
 
 
164 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  29.19 
 
 
159 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.875551 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0825  adenylate cyclase  29.01 
 
 
165 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  31.87 
 
 
157 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  26.25 
 
 
158 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  25.3 
 
 
157 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  30 
 
 
156 aa  50.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  30.63 
 
 
156 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  34.16 
 
 
158 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  27.95 
 
 
158 aa  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  28.57 
 
 
155 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  30.43 
 
 
151 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  31.48 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  27.04 
 
 
161 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>