73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2493 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2493  adenylate cyclase  100 
 
 
170 aa  344  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3082  adenylate cyclase  62.5 
 
 
168 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6613  adenylate cyclase  63.53 
 
 
187 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3399  adenylate cyclase  61.9 
 
 
168 aa  208  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3276  adenylate cyclase  61.54 
 
 
169 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6085  adenylate cyclase  60.37 
 
 
177 aa  195  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0896962  decreased coverage  0.000860765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1805  adenylate cyclase  49.67 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2454  hypothetical protein  48.98 
 
 
166 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0920685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  51.66 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  51.35 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1263  adenylate cyclase  44.97 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.708704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0553  adenylate cyclase  46.67 
 
 
157 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  50.34 
 
 
159 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.875551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0645  adenylate cyclase  47.97 
 
 
154 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0967882  normal  0.674307 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1849  adenylate cyclase  46.31 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  50 
 
 
162 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  46.62 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2545  adenylate cyclase  44.22 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3561  adenylate cyclase  44.22 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  44.9 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1910  adenylate cyclase  42.21 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3052  adenylate cyclase  47.3 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599913  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2597  adenylate cyclase  44.9 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  42.28 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1903  adenylate cyclase  43.33 
 
 
155 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00185179  hitchhiker  0.00135379 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01723  adenylate cyclase  47.4 
 
 
165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2780  adenylate cyclase  46.62 
 
 
157 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2970  adenylate cyclase  46.75 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485889  hitchhiker  0.0000193778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1972  adenylate cyclase  46.62 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2731  adenylate cyclase  43.54 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1325  adenylate cyclase  43.24 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  43.92 
 
 
162 aa  123  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  47.97 
 
 
164 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  43.23 
 
 
157 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1469  adenylate cyclase  42.86 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00690729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1526  putative adenylate cyclase family protein  42.86 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.395104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2092  adenylate cyclase  39.6 
 
 
154 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  40.82 
 
 
158 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  45.21 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  44.9 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  41.5 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  39.07 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2407  hypothetical protein  45.7 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  39.33 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  42.76 
 
 
179 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1305  adenylate cyclase  37.09 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185682  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0285  hypothetical protein  43.71 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  42.18 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02800  hypothetical protein  38.78 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  44.22 
 
 
158 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  40 
 
 
156 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26851  hypothetical protein  42.95 
 
 
166 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4074  adenylate cyclase  41.89 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02281  hypothetical protein  32.86 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0794141  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2877  adenylate cyclase  37.66 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000889515  normal  0.0335198 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1522  hypothetical protein  33.57 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01751  hypothetical protein  30.22 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.690829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0157  hypothetical protein  29.5 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.769937  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01731  hypothetical protein  28.38 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01721  adenylate cyclase  30.87 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0070  hypothetical protein  52.94 
 
 
80 aa  73.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1698  adenylate cyclase  41.36 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409123  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  37.58 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0825  adenylate cyclase  29.75 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01841  hypothetical protein  29.5 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1579  hypothetical protein  32.82 
 
 
218 aa  52  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1116  hypothetical protein  34.23 
 
 
208 aa  48.5  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12700  hypothetical protein  36 
 
 
212 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457956  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2242  hypothetical protein  37.62 
 
 
210 aa  45.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431066  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0307  hypothetical protein  31.19 
 
 
268 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0257  hypothetical protein  24.38 
 
 
462 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.150674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0247  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0658  hypothetical protein  31.36 
 
 
211 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.520841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>