69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3399 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3399  adenylate cyclase  100 
 
 
168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3082  adenylate cyclase  98.81 
 
 
168 aa  330  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3276  adenylate cyclase  88.76 
 
 
169 aa  299  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2493  adenylate cyclase  61.9 
 
 
170 aa  208  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6085  adenylate cyclase  63.41 
 
 
177 aa  204  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0896962  decreased coverage  0.000860765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6613  adenylate cyclase  64.02 
 
 
187 aa  203  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1805  adenylate cyclase  47.71 
 
 
159 aa  144  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3052  adenylate cyclase  49.32 
 
 
167 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599913  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2454  hypothetical protein  46 
 
 
166 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0920685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3561  adenylate cyclase  44.44 
 
 
159 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2545  adenylate cyclase  44.44 
 
 
159 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  44.44 
 
 
155 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  48.03 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1910  adenylate cyclase  42.95 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  48.03 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1903  adenylate cyclase  43.62 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00185179  hitchhiker  0.00135379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1972  adenylate cyclase  46.67 
 
 
153 aa  127  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103162  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1263  adenylate cyclase  42.28 
 
 
157 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.708704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  44.83 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2731  adenylate cyclase  43.79 
 
 
155 aa  121  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0553  adenylate cyclase  44.16 
 
 
157 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  41.06 
 
 
156 aa  121  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  43.24 
 
 
158 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1325  adenylate cyclase  42.28 
 
 
156 aa  120  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  40.13 
 
 
156 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1849  adenylate cyclase  42.76 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2970  adenylate cyclase  44.16 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485889  hitchhiker  0.0000193778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  42.86 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1469  adenylate cyclase  44.81 
 
 
165 aa  117  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00690729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1526  putative adenylate cyclase family protein  44.81 
 
 
165 aa  117  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.395104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  46 
 
 
159 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.875551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2597  adenylate cyclase  41.45 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  40.13 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  42.86 
 
 
164 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2780  adenylate cyclase  42.57 
 
 
157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0645  adenylate cyclase  44.59 
 
 
154 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0967882  normal  0.674307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  41.33 
 
 
158 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  41.18 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  37.33 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  38.82 
 
 
156 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01723  adenylate cyclase  39.61 
 
 
165 aa  104  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1305  adenylate cyclase  35.71 
 
 
166 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2092  adenylate cyclase  36 
 
 
154 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218396  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  43.54 
 
 
158 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  41.78 
 
 
161 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  40.82 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  38.36 
 
 
179 aa  98.2  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02800  hypothetical protein  37.84 
 
 
158 aa  97.4  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4074  adenylate cyclase  41.56 
 
 
156 aa  97.4  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0285  hypothetical protein  40.4 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  38 
 
 
182 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1522  hypothetical protein  33.11 
 
 
166 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02281  hypothetical protein  32.45 
 
 
166 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0794141  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2407  hypothetical protein  39.07 
 
 
168 aa  87.4  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26851  hypothetical protein  38.41 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01751  hypothetical protein  30.94 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.690829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2877  adenylate cyclase  37.66 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000889515  normal  0.0335198 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01731  hypothetical protein  30.41 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0157  hypothetical protein  28.48 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.769937  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01721  adenylate cyclase  29.8 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  41.22 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0070  hypothetical protein  51.47 
 
 
80 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1698  adenylate cyclase  37.09 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409123  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0825  adenylate cyclase  29.22 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01841  hypothetical protein  27.34 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2242  hypothetical protein  30.36 
 
 
210 aa  47.4  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431066  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1116  hypothetical protein  35.25 
 
 
208 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1579  hypothetical protein  34.26 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2481  hypothetical protein  29.59 
 
 
211 aa  41.2  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>