77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6085 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6085  adenylate cyclase  100 
 
 		 177 aa  350  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0896962  decreased coverage  0.000860765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6613  adenylate cyclase  78.79 
 
 		 187 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3276  adenylate cyclase  66.06 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3399  adenylate cyclase  63.41 
 
 		 168 aa  204  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3082  adenylate cyclase  62.8 
 
 		 168 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2493  adenylate cyclase  60.37 
 
 		 170 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3052  adenylate cyclase  52.5 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2454  hypothetical protein  47.62 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0920685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  48.99 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1903  adenylate cyclase  43.24 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00185179  hitchhiker  0.00135379 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3561  adenylate cyclase  45.64 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2545  adenylate cyclase  45.64 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1910  adenylate cyclase  43.62 
 
 		 155 aa  134  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  50 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1263  adenylate cyclase  44.3 
 
 		 157 aa  131  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.708704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  49.32 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2597  adenylate cyclase  46.26 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  46.21 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1805  adenylate cyclase  43.42 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1325  adenylate cyclase  44.52 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  45.95 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2731  adenylate cyclase  44.3 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0645  adenylate cyclase  46.9 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0967882  normal  0.674307 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1849  adenylate cyclase  45.64 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1972  adenylate cyclase  46 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  39.77 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  43.05 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  47.65 
 
 		 157 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0553  adenylate cyclase  44 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  44.38 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1305  adenylate cyclase  41.72 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  41.1 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2970  adenylate cyclase  44.16 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485889  hitchhiker  0.0000193778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  47.02 
 
 		 159 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875551 
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2780  adenylate cyclase  43.24 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1469  adenylate cyclase  42.86 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00690729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1526  putative adenylate cyclase family protein  42.86 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.395104  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  39.74 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  45.21 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  44.9 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01723  adenylate cyclase  47.4 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2092  adenylate cyclase  36.24 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  39.19 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  39.07 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  40.36 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02800  hypothetical protein  37.84 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  39.04 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26851  hypothetical protein  43.05 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  38.41 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2407  hypothetical protein  42.38 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4074  adenylate cyclase  41.22 
 
 		 156 aa  97.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0285  hypothetical protein  40.4 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2877  adenylate cyclase  39.61 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000889515  normal  0.0335198 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01721  adenylate cyclase  30.07 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02281  hypothetical protein  32.21 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0794141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1522  hypothetical protein  31.79 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01731  hypothetical protein  27.7 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01751  hypothetical protein  29.5 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.690829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0157  hypothetical protein  26.62 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.769937  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0070  hypothetical protein  52.94 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  40.54 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0825  adenylate cyclase  31.93 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1698  adenylate cyclase  39.75 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409123  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01841  hypothetical protein  26.17 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0658  hypothetical protein  31.93 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0247  hypothetical protein  31.95 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2242  hypothetical protein  31.36 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431066  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2481  hypothetical protein  31.18 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0675  hypothetical protein  30.18 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1116  hypothetical protein  36.27 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0462  adenylate cyclase  31.36 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1579  hypothetical protein  32.82 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12700  hypothetical protein  36.73 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2298  hypothetical protein  31.97 
 
 		 266 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173529  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2130  hypothetical protein  33.73 
 
 		 328 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306519  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0307  hypothetical protein  30.12 
 
 		 268 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>