65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_12700  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457956  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1579  hypothetical protein  62.44 
 
 
218 aa  282  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2242  hypothetical protein  60.68 
 
 
210 aa  254  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431066  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2481  hypothetical protein  57.64 
 
 
211 aa  244  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1116  hypothetical protein  51.24 
 
 
208 aa  218  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0675  hypothetical protein  51.92 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0247  hypothetical protein  48.33 
 
 
207 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0658  hypothetical protein  49.05 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0462  adenylate cyclase  46.31 
 
 
210 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26851  hypothetical protein  33.15 
 
 
166 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  30.68 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01721  adenylate cyclase  34.51 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1522  hypothetical protein  37.25 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2407  hypothetical protein  33.71 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02281  hypothetical protein  37.25 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0794141  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0285  hypothetical protein  32.79 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0645  adenylate cyclase  37.84 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0967882  normal  0.674307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1903  adenylate cyclase  37.38 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00185179  hitchhiker  0.00135379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2597  adenylate cyclase  37.74 
 
 
159 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  31.11 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  26.37 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2454  hypothetical protein  31.69 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0920685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01751  hypothetical protein  31.82 
 
 
165 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.690829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  36.11 
 
 
158 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0157  hypothetical protein  29.36 
 
 
165 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.769937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1972  adenylate cyclase  33.08 
 
 
153 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103162  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  39.81 
 
 
155 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01731  hypothetical protein  31.78 
 
 
157 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  36.45 
 
 
156 aa  62  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  40.82 
 
 
158 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2731  adenylate cyclase  36.45 
 
 
155 aa  61.6  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02800  hypothetical protein  25.14 
 
 
158 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  41.84 
 
 
164 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1305  adenylate cyclase  35.4 
 
 
166 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0553  adenylate cyclase  36.45 
 
 
157 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2092  adenylate cyclase  35.85 
 
 
154 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1849  adenylate cyclase  39.81 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2970  adenylate cyclase  33.33 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485889  hitchhiker  0.0000193778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  35 
 
 
161 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  33.33 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1263  adenylate cyclase  32.14 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.708704  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  34.26 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1526  putative adenylate cyclase family protein  33.33 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.395104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1469  adenylate cyclase  33.33 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00690729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  34.91 
 
 
157 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  29.82 
 
 
162 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  31.98 
 
 
182 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  31.06 
 
 
179 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1325  adenylate cyclase  31.78 
 
 
156 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  27.06 
 
 
151 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  29.24 
 
 
162 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2545  adenylate cyclase  29.84 
 
 
159 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1910  adenylate cyclase  34.91 
 
 
155 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3561  adenylate cyclase  29.84 
 
 
159 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  34.58 
 
 
156 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1805  adenylate cyclase  33.96 
 
 
159 aa  48.1  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  30.84 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01723  adenylate cyclase  38.36 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2493  adenylate cyclase  36 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01841  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6085  adenylate cyclase  36.73 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0896962  decreased coverage  0.000860765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2780  adenylate cyclase  35.35 
 
 
157 aa  45.1  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6613  adenylate cyclase  38.38 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1698  adenylate cyclase  34.31 
 
 
156 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409123  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  26.74 
 
 
159 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.875551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>