25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1680 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1680  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  202  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124193  normal  0.187707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3310  hypothetical protein  64.29 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2416  hypothetical protein  60.71 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178664  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2417  hypothetical protein  55.95 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0899088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2364  hypothetical protein  58.33 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1338  hypothetical protein  55.95 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  hitchhiker  0.000782124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1712  hypothetical protein  52.38 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197592  hitchhiker  0.00000613594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1931  hypothetical protein  55.29 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3299  hypothetical protein  51.76 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2021  hypothetical protein  50.6 
 
 		 87 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3620  hypothetical protein  35.44 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00315383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0763  hypothetical protein  35.44 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000422507  unclonable  0.0000111786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2011  hypothetical protein  35.44 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3273  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0734  hypothetical protein  35.44 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.012611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0759  hypothetical protein  35.44 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000715383  normal  0.0622398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0754  transcriptional regulator PrtN  32.53 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07950  transcriptional regulator PrtN  35.38 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0561092  hitchhiker  0.00216354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3031  pyocin R2_PP, transcriptional activator prtN  29.49 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453113  normal  0.0918719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0369  hypothetical protein  26.19 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102727  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1187  transcriptional regulator PrtN, putative  45.28 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326709  normal  0.224267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0570  transcriptional regulator PrtN, putative  46.81 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4605  transcriptional regulator PrtN, putative  46.81 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3425  transcriptional regulator, putative  29.17 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000176936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>