17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2021 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2021  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2364  hypothetical protein  45.88 
 
 		 94 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1680  hypothetical protein  50.6 
 
 		 97 aa  84.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124193  normal  0.187707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2417  hypothetical protein  43.53 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0899088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3310  hypothetical protein  45.78 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1712  hypothetical protein  42.35 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197592  hitchhiker  0.00000613594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1338  hypothetical protein  44.71 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  hitchhiker  0.000782124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1931  hypothetical protein  47.67 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2416  hypothetical protein  39.76 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178664  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3299  hypothetical protein  37.65 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0369  hypothetical protein  32.14 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102727  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0754  transcriptional regulator PrtN  32.39 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5532  hypothetical protein  32.91 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07950  transcriptional regulator PrtN  32.39 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0561092  hitchhiker  0.00216354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3031  pyocin R2_PP, transcriptional activator prtN  34.33 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453113  normal  0.0918719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3988  hypothetical protein  35.38 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0146108  normal  0.105596 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0703  hypothetical protein  24.05 
 
 		 87 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>