17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0703 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0703  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0369  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5532  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3273  hypothetical protein  39.74 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0759  hypothetical protein  38.46 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000715383  normal  0.0622398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2011  hypothetical protein  38.46 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0763  hypothetical protein  38.46 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000422507  unclonable  0.0000111786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3620  hypothetical protein  38.46 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00315383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0734  hypothetical protein  38.46 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.012611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3310  hypothetical protein  29.76 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1712  hypothetical protein  26.51 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197592  hitchhiker  0.00000613594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2364  hypothetical protein  27.38 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2416  hypothetical protein  30.59 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178664  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2417  hypothetical protein  25.93 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0899088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1931  hypothetical protein  27.38 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1338  hypothetical protein  28.75 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  hitchhiker  0.000782124 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2021  hypothetical protein  24.05 
 
 		 87 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>