18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0759 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0759  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000715383  normal  0.0622398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3620  hypothetical protein  98.84 
 
 
86 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00315383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0734  hypothetical protein  98.84 
 
 
86 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.012611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0763  hypothetical protein  97.67 
 
 
86 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000422507  unclonable  0.0000111786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2011  hypothetical protein  97.67 
 
 
86 aa  173  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3273  hypothetical protein  85.54 
 
 
83 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5532  hypothetical protein  46.05 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0703  hypothetical protein  38.46 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2417  hypothetical protein  40.7 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0899088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0369  hypothetical protein  32.94 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3310  hypothetical protein  38.75 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2364  hypothetical protein  39.29 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1712  hypothetical protein  38.55 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197592  hitchhiker  0.00000613594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1931  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1680  hypothetical protein  35.44 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124193  normal  0.187707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2416  hypothetical protein  35 
 
 
86 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1338  hypothetical protein  29.27 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  hitchhiker  0.000782124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3425  transcriptional regulator, putative  32.35 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000176936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>