19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1931 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1931  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  219  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2364  hypothetical protein  60.23 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1712  hypothetical protein  56.82 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197592  hitchhiker  0.00000613594 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2417  hypothetical protein  55.29 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0899088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1680  hypothetical protein  55.29 
 
 		 97 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124193  normal  0.187707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3310  hypothetical protein  55.17 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2416  hypothetical protein  51.76 
 
 		 86 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1338  hypothetical protein  51.65 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  hitchhiker  0.000782124 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2021  hypothetical protein  47.67 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3299  hypothetical protein  47.73 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3273  hypothetical protein  37.04 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0734  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.012611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0759  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000715383  normal  0.0622398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0369  hypothetical protein  34.52 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3620  hypothetical protein  32.1 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00315383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5532  hypothetical protein  36.9 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0763  hypothetical protein  32.1 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000422507  unclonable  0.0000111786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2011  hypothetical protein  32.1 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0703  hypothetical protein  27.38 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>