18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0369 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0369  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102727  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0703  hypothetical protein  52.94 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5532  hypothetical protein  44.05 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3273  hypothetical protein  35.29 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3620  hypothetical protein  34.12 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00315383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2011  hypothetical protein  34.12 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0763  hypothetical protein  34.12 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000422507  unclonable  0.0000111786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0759  hypothetical protein  32.94 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000715383  normal  0.0622398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0734  hypothetical protein  32.94 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.012611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2417  hypothetical protein  34.12 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0899088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1931  hypothetical protein  34.52 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3310  hypothetical protein  32.14 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2364  hypothetical protein  27.38 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1712  hypothetical protein  30.38 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197592  hitchhiker  0.00000613594 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2021  hypothetical protein  32.14 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1680  hypothetical protein  26.19 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124193  normal  0.187707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1338  hypothetical protein  32.14 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  hitchhiker  0.000782124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2416  hypothetical protein  31.4 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>