18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5532 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5532  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  205  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0703  hypothetical protein  35.63 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0734  hypothetical protein  46.15 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.012611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0369  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0759  hypothetical protein  46.05 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000715383  normal  0.0622398 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3273  hypothetical protein  47.37 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0763  hypothetical protein  44.87 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000422507  unclonable  0.0000111786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2011  hypothetical protein  44.87 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000243712  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3620  hypothetical protein  44.74 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00315383  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2417  hypothetical protein  44.71 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0899088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2416  hypothetical protein  39.53 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3310  hypothetical protein  37.8 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1712  hypothetical protein  33.73 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197592  hitchhiker  0.00000613594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2364  hypothetical protein  34.78 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1931  hypothetical protein  36.9 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1680  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124193  normal  0.187707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1338  hypothetical protein  30.95 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  hitchhiker  0.000782124 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2021  hypothetical protein  32.91 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>