34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0486 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0486  BA14K family protein  100 
 
 		 137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  44.59 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  47.62 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  43.92 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  43.92 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  61.33 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  61.33 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0553  hypothetical protein  35.98 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0587  hypothetical protein  35.98 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3651  BA14K family protein  54.95 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5426  BA14K family protein  45.54 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  78.38 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  58.49 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0181  hypothetical protein  38.06 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.323413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1497  BA14K-like  46.51 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00686044  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0196  BA14K family protein  71.43 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.994996  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0187  hypothetical protein  38.06 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1335  hypothetical protein  29.93 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20154  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1377  hypothetical protein  49.09 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  43.21 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  69.44 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2503  BA14K family protein  66.67 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1816  BA14K family protein  47.27 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2512  BA14K family protein  75.76 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.289325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  33.76 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2510  BA14K family protein  75.86 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.283811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1851  BA14K family protein  43.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.183418 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4777  BA14K family protein  31.21 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1878  hypothetical protein  46.51 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0100  hypothetical protein  38.83 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1502  BA14K family protein  43.9 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693062  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0110  hypothetical protein  41.33 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3461  hypothetical protein  55.56 
 
 		 177 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.81748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1399  BA14K family protein  39.02 
 
 		 193 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>