25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1851 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1851  BA14K family protein  100 
 
 
134 aa  278  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183418 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4777  BA14K family protein  75.91 
 
 
134 aa  201  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  44.44 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  50 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1497  BA14K-like  41.56 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00686044  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  37.37 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  48.28 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1335  hypothetical protein  47.27 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20154  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1377  hypothetical protein  47.27 
 
 
171 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0553  hypothetical protein  61.11 
 
 
253 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  41.67 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  41.54 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0587  hypothetical protein  61.11 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  36.76 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3651  BA14K family protein  58.33 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1816  BA14K family protein  60.61 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  58.82 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  58.82 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0196  BA14K family protein  62.86 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.994996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0486  BA14K family protein  43.33 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0181  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.323413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2503  BA14K family protein  54.29 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0187  hypothetical protein  57.14 
 
 
129 aa  44.3  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1878  hypothetical protein  31.17 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  36.84 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>