32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6139 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  41.95 
 
 
161 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  37.8 
 
 
151 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  67.69 
 
 
157 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  39.05 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0553  hypothetical protein  43.1 
 
 
253 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0587  hypothetical protein  41.95 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  58.06 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  58.06 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3651  BA14K family protein  36.11 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0196  BA14K family protein  53.09 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.994996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  36.02 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  36.02 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0181  hypothetical protein  78.38 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.323413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  80.56 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2503  BA14K family protein  72.09 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1497  BA14K-like  70.45 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00686044  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0187  hypothetical protein  75.68 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0486  BA14K family protein  50.7 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1851  BA14K family protein  37.37 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2512  BA14K family protein  75 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.289325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1816  BA14K family protein  30.86 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2510  BA14K family protein  76.67 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.283811 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1335  hypothetical protein  65.62 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20154  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1377  hypothetical protein  65.62 
 
 
171 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  27.62 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4777  BA14K family protein  31.25 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  44.07 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1878  hypothetical protein  63.33 
 
 
229 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  32.1 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1431  glycosyl transferase family protein  51.61 
 
 
300 aa  40.8  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.588983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1502  BA14K family protein  41.03 
 
 
193 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693062  normal  0.528738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>