29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0187 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0187  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0181  hypothetical protein  98.45 
 
 
129 aa  253  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.323413  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0196  BA14K family protein  71.43 
 
 
139 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.994996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  34.94 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  75.68 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  78.38 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  69.57 
 
 
180 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0553  hypothetical protein  71.79 
 
 
253 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  66.67 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0486  BA14K family protein  56.52 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3651  BA14K family protein  34.25 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  66.67 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0587  hypothetical protein  71.79 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2503  BA14K family protein  52.17 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  33.33 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2512  BA14K family protein  73.68 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.289325 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  36.09 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  36.09 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1816  BA14K family protein  50 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2510  BA14K family protein  72.5 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.283811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  33.54 
 
 
161 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1497  BA14K-like  58.18 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00686044  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1335  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20154  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1377  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5426  BA14K family protein  63.64 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1851  BA14K family protein  57.14 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  56.41 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4777  BA14K family protein  57.58 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1878  hypothetical protein  66.67 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>