38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0984 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  307  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  47.44 
 
 
151 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  44.65 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  61.25 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  61.25 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  41.06 
 
 
147 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  41.06 
 
 
147 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5426  BA14K family protein  46.09 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504216 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0553  hypothetical protein  39.33 
 
 
253 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0587  hypothetical protein  39.18 
 
 
166 aa  72  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3651  BA14K family protein  42.29 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0486  BA14K family protein  46.91 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0100  hypothetical protein  39.09 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  33.33 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0110  hypothetical protein  40.91 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  30.39 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  49.21 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  32.24 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1878  hypothetical protein  25.83 
 
 
229 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0196  BA14K family protein  38.52 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.994996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1497  BA14K-like  46.67 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00686044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1502  BA14K family protein  43.24 
 
 
193 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693062  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0181  hypothetical protein  54.35 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.323413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  57.58 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2503  BA14K family protein  54.55 
 
 
178 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0187  hypothetical protein  54.35 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1851  BA14K family protein  32.35 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  41.27 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1399  BA14K family protein  47.06 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500757  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  37.65 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  42.86 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3461  hypothetical protein  51.52 
 
 
177 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.81748  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  42.86 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1816  BA14K family protein  48.48 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  42.86 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1377  hypothetical protein  45.45 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1335  hypothetical protein  45.45 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3760  putative transporter protein  35.06 
 
 
117 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>