23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4777 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4777  BA14K family protein  100 
 
 
134 aa  278  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1851  BA14K family protein  75.91 
 
 
134 aa  201  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  32.68 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1377  hypothetical protein  51.28 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1335  hypothetical protein  51.28 
 
 
171 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20154  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  40.54 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  40.3 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1816  BA14K family protein  49.02 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  43.28 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  40.85 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  51.22 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  51.22 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1497  BA14K-like  60.61 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00686044  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0553  hypothetical protein  57.58 
 
 
253 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0587  hypothetical protein  57.58 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0486  BA14K family protein  57.14 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3651  BA14K family protein  52.78 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  60.61 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0196  BA14K family protein  63.64 
 
 
139 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.994996  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  59.38 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0181  hypothetical protein  60.61 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.323413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2503  BA14K family protein  57.58 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0187  hypothetical protein  57.58 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>