33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0671 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  100 
 
 
157 aa  323  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  44.05 
 
 
161 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  44.51 
 
 
156 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  40 
 
 
180 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  41.07 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  42.94 
 
 
151 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  60.94 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  60.94 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3651  BA14K family protein  37.57 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0587  hypothetical protein  33.71 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0553  hypothetical protein  33.71 
 
 
253 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  43.05 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  43.05 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1497  BA14K-like  72.92 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00686044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2503  BA14K family protein  71.11 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0486  BA14K family protein  78.38 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0196  BA14K family protein  35.8 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.994996  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0181  hypothetical protein  81.08 
 
 
129 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.323413  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0187  hypothetical protein  78.38 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1851  BA14K family protein  32.32 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2510  BA14K family protein  37.95 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.283811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2512  BA14K family protein  65.79 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.289325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  43.21 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1816  BA14K family protein  63.64 
 
 
139 aa  54.3  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4777  BA14K family protein  40.23 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1335  hypothetical protein  47.73 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20154  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1377  hypothetical protein  47.73 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3461  hypothetical protein  40.91 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.81748  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  36.63 
 
 
129 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  40.32 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1878  hypothetical protein  34.25 
 
 
229 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5426  BA14K family protein  31.03 
 
 
122 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1502  BA14K family protein  60.71 
 
 
193 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693062  normal  0.528738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>