36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1878 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1878  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  473  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1502  BA14K family protein  44.83 
 
 
193 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0693062  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1399  BA14K family protein  43.97 
 
 
193 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500757  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1497  BA14K-like  53.49 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00686044  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3884  BA14K family protein  42.59 
 
 
151 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0598  BA14K family protein  43.75 
 
 
159 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141665  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0550  BA14K family protein  43.75 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353622  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1780  BA14K family protein  48.78 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0210  hypothetical protein  55.56 
 
 
147 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0553  hypothetical protein  63.33 
 
 
253 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0486  BA14K family protein  46.51 
 
 
137 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0671  BA14K family protein  66.67 
 
 
157 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2510  BA14K family protein  61.11 
 
 
160 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.283811 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0587  hypothetical protein  63.33 
 
 
166 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0181  hypothetical protein  70 
 
 
129 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.323413  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6139  hypothetical protein  63.33 
 
 
157 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3651  BA14K family protein  63.33 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2503  BA14K family protein  47.22 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0196  BA14K family protein  66.67 
 
 
139 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.994996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3461  hypothetical protein  47.22 
 
 
177 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.81748  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0688  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  60 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0735  immunoreactive 14 kDa protein BA14k  60 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0812  BA14K family protein  50 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0984  hypothetical protein  48.48 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2512  BA14K family protein  64.52 
 
 
173 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.289325 
 
 
-
 
NC_004310  BR1377  hypothetical protein  44.68 
 
 
171 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1335  hypothetical protein  38.24 
 
 
171 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20154  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1851  BA14K family protein  31.17 
 
 
134 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.183418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1816  BA14K family protein  50 
 
 
139 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2214  BA14K family protein  64.52 
 
 
161 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611064  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0187  hypothetical protein  66.67 
 
 
129 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  61.29 
 
 
626 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4248  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  61.29 
 
 
763 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  58.06 
 
 
658 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4513  BA14K family protein  40.48 
 
 
139 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050072  decreased coverage  0.007325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>